BigWig нь Wiggle (WIG) форматаас хөрвүүлэх замаар бүтээгдсэн геном хөтчийн замд нягт, тасралтгүй өгөгдлийг харуулахфайлын формат юм. BigWig форматыг UCSC Genome Bioinformatics вэб сайтад тайлбарласан бөгөөд Broad Institute файлын форматын гарын авлага нь нэмэлт мэдээлэл өгдөг.
BigWig формат гэж юу вэ?
BigWig формат нь нягт, тасралтгүй өгөгдлийг график хэлбэрээр харуулахад зориулагдсан BigWig файлуудыг UCSC wigToBigWig програмыг ашиглан WIG төрлийн файлуудаас анх үүсгэсэн. Мөн UCSC bedGraphToBigWig програмыг ашиглан bedGraph файлуудаас bigWig файл үүсгэж болно.
Би bigWig файлыг хэрхэн ашиглах вэ?
Шинээр үүсгэсэн bigWig файлыг зөөх (myBigWig.bw) вэбээр нэвтрэх боломжтой http, https эсвэл ftp байршил руу. URL-г тусгай дууны бичлэгийн маягт руу буулгах эсвэл нэг мөрийг ашиглан захиалгат зам үүсгээрэй. Захиалгат дууны мөрийг тусгай замын удирдлагын хуудасны текст талбарт буулгана уу.
BigWig гэж юу вэ?
bigWig Tracks нь геномыг бүхэлд нь дамжих тасралтгүй дохионы зам юм. Эдгээр нь ChIP-Seq дохио, RNA-Seq дохио гэх мэт янз бүрийн "түүхий" туршилтын үр дүнг харуулахад тохиромжтой.
Би bigWig файлыг хэрхэн үүсгэх вэ?
Том файл үүсгэх олон арга бий. Үүнд ихэвчлэн a хөрвүүлэх үйл ажиллагаа орно. bam файлыг хөдөлгөх зам (. wig) болгон хувиргаж, дараа нь хөдөлгөөнт замыг хоёртын том файл болгон хувиргаж байна (.
